3. RNA二级结构预测
I. 上机指南
An Examples of Recursion, Trace Back and VW Tables
II. 上机任务:
在Windows或Mac中下载RNAstructure软件(下载地址),安装正确版本的RNAStructure,并尝试在windows界面下预测任意RNA序列的二级结构。
阅读和理解 “recursion, trace back and VW tables.pdf”,了解Dynamic Programing 在RNA Secondary Structure中的应用。
在Linux Terminal下阅读“Structure Prediction Codes Example”中的source code,尝试运行。
III. 上机作业:
完成VW Table (maximizing the hydrogen bonds: GC=3,AU=2,GU=2)。
解释你对Dynamic Programing 在RNA Secondary Structure Prediction(maximizing the hydrogen bonds)中应用的理解。